최초의 병징은 과점을 중심으로 갈색의 작고 둥근 반점이 생기는데, 이 반점의 주위는 붉게 착색되어 눈에 잘 띈다. 병반이 확대되면 둥근 띠모양으로 테가 생기지만 띠모양이 확실하지 않는 경우도 있고, 과실이 썩으면서 색깔이 검게 변하는 것도 있다. 가지에서의 병반은 사마귀를 형성하는 것과 사마귀를 형성하지 않고 조피증상을 나타내는 것, 검붉은 색의 암종을 형성하는 것의 3가지 유형으로 나누어진다.

병원균은 사마귀 조피증상이나 가지마름증상, 전년도 이병과실에서 월동한다. 다음해 5월 중순~8월 하순경 사이 비가 올 때 포자가 누출되고 빗물에 튀어 과실의 과점 속에서 잠복한다. 이후 과실이 성숙되어 수용성 전분함량이 10.5%에 달하는 생육후기에 발병한다. 일부 일소피해를 입은 과실에서는 7월 하순에 발병하는 경우도 있지만 대부분 9월 하순 이후에 다발생하며, 초기에 발병된 과실에서는 병반 상에 작은 흑색소립 형태로 나타난다.

석회보르도액을 적절하게 살포한다면 갈색무늬병과 마찬가지로 방제가 가능한 병해이다. 문제가 된다면 병원균의 월동처에서 비산된 포자가 과실에 부착하지 못하게 하는 봉지씌우기 재배로 해결이 가능하다. 유목기부터 토양내 유기물을 충분히 주고 물관리를 철저히 해 줄기에 진물증상과 사마귀가 생기지 않게 한다. 전정한 나뭇가지를 과수원 바닥에 방치하게 되면 여기에 병원균이 부생적으로 기생해 다량의 포자를 형성하게 되고, 이들이 전염원이 될 수도 있기 때문에 과수원 밖으로 제거한다

5월부터 가을에 걸쳐서 신초 선단부의 연한 잎을 가해해 뒤쪽으로 말리게 한다. 5월에 탁엽 등을 가해하면 붉은 반점이 생기며 잎이 뒤쪽으로 세로로 말린다. 심하게 피해를 받은 가지는 가늘고 약한 가지들이 많이 나와서 결실가지로 사용하지 못하게 된다.

사과 수확 후인 11월 하순경 월동알을 대상으로 기계유유제를 살포하고, 3월 중하순~4월 상순에 기계유유제를 1~2회 살포하면 거의 대부분 방제가 가능하다. 그러나 방제가 미흡하면 낙화기 이후 유화식용유나 식물추출물 중 진딧물에 효과가 있는 제품을 추가 살포한다. 홍로 품종의 가지에 월동알의 밀도가 높은 경향이므로 후지 품종보다 홍로 품종에서 방제를 철저히 해야 한다. 9~10월이 되어도 신초 신장이 계속되면 다음해 발생이 많게 되므로, 적당한 시비관리로 수세를 안정시키는 것이 다음해 봄철 발생을 적게 한다. 사과혹진딧물 피해를 받은 가지를 6월 중순에서 7월 상순에 걸쳐 기부에서 잎을 4~6매 정도 두고 절단한다. 꽃눈분화가 36~41.4% 정도 되고 가지의 재신장이 5cm 이상이 되어 수세회복과 익년도 결실 안정에 기여한다.

부화한 유충이 뚫고 들어간 과실의 피해 구멍은 바늘로 찌른 정도로 작으며 약간 부풀게 된다. 거기서 즙액이 나와 이슬방울처럼 맺혔다가 시간이 지나면 말라붙어 흰가루 같이 보인다. 피해는 2가지 형태로 구분할 수 있다. 첫째, 과육 안으로 파고 들어가서 먹는 유충은 과심부까지 들어가 종자부를 먹고 그 주위 내부까지 피해를 준다. 둘째는 과피 부분의 비교적 얕은 부분을 먹고 다니므로 그 흔적이 선상으로 착색이 되고 약간 기형과로 되며, 점차로 과심부까지 도달하는 경우가 있다. 노숙유충이 되면 겉에 1~2mm의 구멍을 내고 나오며 이때 겉으로 똥을 배출하지 않는다.

사과원 근처에 관리 소홀원이 있으면 발생이 많으므로 주의한다. 관리방안은 복숭아순나방과 동일하지만, 월동장소가 토양 속으로 줄기의 거친 껍질 틈에서 월동하는 복숭아순나방과는 다르므로 휴면기 중에 월동유충의 방제나 월동충의 유살 등이 불가능하다. 대부분의 유기재배 사과원에서 교미교란제를 사용해 방제를 한다. 주기적으로 관찰해 피해 과실은 보이는 대로 따서 물에 담가 과실 속의 유충을 죽인다. 수출을 위한 재배농가에서는 6월 상순 이전에 봉지씌우기를 해 사전에 예방한다. 10월 중순 이전에 사과를 수확하면 일부는 유충이 계속 사과 속에 살아남아 있는 경우도 있으므로 최종 수확 시 피해과실을 철저히 선별해 제거해야 한다.